Z hlavního vlakového nádraží v Olomouci je areál nemocnice dostupný tramvají (linkami číslo 1, 4 a 6) a autobusy (číslo 12, 19, 26 – zastávka Dvořákova; 21 – zastávka Lékařská fakulta).
Od autobusového nádraží lze do FN Olomouc dojet tramvají (linka č. 4) a autobusy (č. 19 – Dvořákova).
Pro imobilní pacienty pak přepravu po areálu nemocnice zajišťuje autobus číslo 42, který vyjíždí od tramvajových zastávek u nemocnice.
Areál nemocnice je přístupný bránami z ulic I. P. Pavlova a Hněvotínské a vstupem pouze pro pěší od tramvajových zastávek z Brněnské ulice.